RNAi biblioteks ressource – Københavns Universitet

Videresend til en ven Resize Print Bookmark and Share

Erhvervssamarbejde > Brug KU's faciliteter > Udstyr liste > RNAi biblioteks ressource

19. november 2012

RNAi biblioteks ressource

Tekniske specifikationer
Vi har forskellige siRNA og shRNA biblioteker.

siRNA biblioteker: Vi har i øjeblikket 6 forskellige tilpassede Human Silencer® siRNA biblioteker fra Applied Biosystems:

• Kinome
• Phosphatome
• Customized Nucleic Acid Binding factors (NAB5)
• Selected DNA Repair factors (NAB1)
• Selected Chromatin Remodelling factors (NAB3)
• Ubiquitome

Hvert target-gen er repræsenteret af tre individuelle siRNA konstrukter. Aliquots af de individuelle sublibraries kan erhverves i en mængde på 0.04pmol siRNA i 384-brønds format.

shRNA biblioteker: Vi har store dele af Thermo Scientific Open Biosystems pGIPZ Lentiviral shRNAmir Human and Mouse Whole Genome libraries. og kan tilbyde konstrukter fra:

• Human pGIPZ shRNAmir releases 6.1 - 6.15
• Mouse pGIPZ shRNAmir releases 7.1 - 7.13

De to biblioteker består af omkring 72.000 (humane) og 62.400 (muse) konstrukter mod både annoterede og ikke-annoterede gener. Der vil typisk være 2-5 tilgængelige konstrukter per gen, der kan erhverves enten i form af enkelte kolonier, glycerol-stocks eller plasmid preps. 

De to pGIPZ Lenitiviral shRNAmir biblioteker dækker hele genomer. Således kan konstrukter, der evt skulle mangle i vores library, erhverves direkte hos Open Biosystems.

Udstyrets anvendelse
RNAi baserede knockdown eksperimenter enten til individuelle targets eller i screen-format.

Målgruppe
Enhver på Københavns Universitet.

Yderligere information
Læs mere på www.bric.ku.dk/core_facilities/HTscreens/.